Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms