Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms