Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ5

SGMS1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1Q86VZ5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS1Q86VZ5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS1Q86VZ5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms