Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRCQ7RTU9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms