Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR3Q6ZT12 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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