Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HES3Q5TGS1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms