Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UPP1Q16831 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms