Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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