Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS72Q15906 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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