Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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