Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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