Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATRQ13535 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATRQ13535 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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