Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SNHG15-204ENST00000579383 731 ntTSL 215.81■□□□□ 0.122e-16■■■■□ 20.9
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PABPC4Q13310 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.18e-9■■■■□ 20.9
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PABPC4Q13310 PCGF2-207ENST00000620225 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.448e-9■■■■□ 20.9
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PABPC4Q13310 PIGT-255ENST00000640175 1429 ntTSL 215.85■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 20.8
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PABPC4Q13310 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-9■■■■□ 20.8
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PABPC4Q13310 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.291e-6■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.411e-6■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 DPH5-209ENST00000481871 972 ntTSL 55.63□□□□□ -1.511e-6■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 DCXR-213ENST00000580320 915 ntTSL 226.06■■□□□ 1.764e-11■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 DCXR-207ENST00000578885 968 ntTSL 525.55■■□□□ 1.684e-11■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 DCXR-210ENST00000579334 1251 ntTSL 525.46■■□□□ 1.674e-11■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.654e-11■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 DCXR-214ENST00000580750 1076 ntTSL 524.78■■□□□ 1.564e-11■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.714e-7■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.182e-8■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.852e-8■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.812e-8■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 TIMM17B-205ENST00000466995 1528 ntTSL 217.85■□□□□ 0.452e-8■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-8■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.063e-9■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 MED13L-208ENST00000552023 413 ntTSL 37.53□□□□□ -1.23e-9■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.949e-10■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.41e-6■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.692e-7■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 PHPT1-205ENST00000492540 1316 ntTSL 1 (best)23.62■■□□□ 1.372e-7■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.032e-7■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 PHPT1-203ENST00000462205 619 ntTSL 317.22■□□□□ 0.352e-7■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 PHPT1-206ENST00000497413 618 ntTSL 216.11■□□□□ 0.172e-7■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.761e-20■■■■□ 20.8
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