Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMAN2Q12907 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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