Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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