Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms