Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDLBPQ00341 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms