Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BACE1P56817 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BACE1P56817 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BACE1P56817 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BACE1P56817 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BACE1P56817 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BACE1P56817 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BACE1P56817 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BACE1P56817 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms