Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NSG1P42857 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NSG1P42857 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NSG1P42857 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NSG1P42857 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NSG1P42857 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms