Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MLH1P40692 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MLH1P40692 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MLH1P40692 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MLH1P40692 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MLH1P40692 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MLH1P40692 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms