Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRBP28702 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRBP28702 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRBP28702 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRBP28702 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRBP28702 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRBP28702 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRBP28702 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRBP28702 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRBP28702 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRBP28702 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRBP28702 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRBP28702 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRBP28702 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRBP28702 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRBP28702 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRBP28702 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRBP28702 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRBP28702 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRBP28702 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRBP28702 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRBP28702 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRBP28702 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRBP28702 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRBP28702 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRBP28702 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms