Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms