Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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