Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms