Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPM2P07951 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TPM2P07951 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM2P07951 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM2P07951 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM2P07951 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPM2P07951 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM2P07951 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM2P07951 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM2P07951 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM2P07951 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM2P07951 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM2P07951 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM2P07951 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPM2P07951 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPM2P07951 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPM2P07951 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM2P07951 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms