Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP3O75154 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP3O75154 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms