Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL13O43927 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms