Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTIFO43310 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTIFO43310 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTIFO43310 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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