Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPBD1B2RD01 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms