Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTL1A6NKG5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms