Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB4A4D0S4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB4A4D0S4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms