Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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