Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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