Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms