Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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PTPRRQ15256 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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PTPRRQ15256 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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PTPRRQ15256 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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PTPRRQ15256 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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PTPRRQ15256 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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PTPRRQ15256 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PTPRRQ15256 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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PTPRRQ15256 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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