Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms