Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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