Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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