Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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