Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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