Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms