Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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