Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
EPHB4P54760 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms