Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 DDX52-213ENST00000617633 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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CENPFP49454 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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CENPFP49454 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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CENPFP49454 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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