Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms