Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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