Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms