Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms