Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 AC025430.1-201ENST00000561324 498 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC010542.3-202ENST00000561728 701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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