Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms